Jesli jest dużo braków w kosztorysie to uznać ofertę jako niezgodna z SIWZ.
Jeżeli brak jest 1 lub 2 pozycji to sugeruję wyrok KIO 556/12 z dn. 3 kwietnia 2012 roku - Zamawiający na podstawie art. 87 ust. 2 pkt 3 ustawy poprawi inne omyłki polegające na niezgodności oferty ze specyfikacją istotnych warunków zamówienia tj. uzupełni kosztorys ofertowy o brakującą pozycję i przyjmie, iż cena jednostkowa tej pozycji wynosi 0 zł (przyjmując, że cena została uwzględniona w innych pozycjach kosztorysu ofertowego) powiadamiając o tym niezwłocznie Wykonawcę 